Es un departamento de la Dirección Administrativa Financiera, que inició sus funciones en el mes de abril de 2008. Su función principal es centralizar la documentación que produce toda la entidad. Cuenta con tres áreas bien definidas: el área administrativa, los depósitos donde se conservan los documentos y el área o sala de consulta de los mismos.
Dentro de algunos de los tipos documentales que conserva se pueden mencionar Actas de Junta Directiva, Planes Anuales Operativos y Presupuestos, Informes de Cumplimiento y Ejecución de los Planes Operativos Institucionales y Presupuestos, Correspondencia de las distintas unidades administrativas, Expedientes de Becas de centros educativos entre otros. Las fechas extremas de los documentos datan de 1976 a la fecha.